Một lá thư bí ẩn mà Kid để lại tại nhà kho của tập đoàn Atoe ở Hakodate của Hokkaido, đã đánh dấu một cuộc phiêu lưu mới đầy kịch tính cho Movie 27. Lần này, mục tiêu của Kid không phải là một món báu vật có giá trị, mà là thanh kiếm của Toshizo Hijikata - Phó tướng của đội quân samurai cuối cùng mang tên Shinsengumi thời kỳ Edo. Sự lựa chọn này đặt ra câu hỏi: Tại sao Kid quan tâm đến thanh kiếm đặc biệt này ? Trong khi đó, Heiji, Conan và đồng đội đang tham gia thi đấu Kendo tại Hakodate. Khả năng Heiji phát hiện mặt Kid và bắt đầu một cuộc truy đuổi gay cấn là điều không thể tránh khỏi. Liệu cuộc đụng độ này có làm sáng tỏ về kế hoạch của Kid hay không? Tại một nhà kho bí ẩn thuộc Hakodate, vụ án mạng bí ẩn liên quan đến một thi thể chứa vết chém trên ngực đã xảy ra. Trong quá trình điều tra, cảnh sát phát hiện một kẻ buôn bán vũ khí quốc tế đang săn lùng kho báu được giấu kín bởi gia tộc Akie. Những người này đã có ảnh hưởng sâu rộng vào quân đội thời chiến ở Hakodate. Lời đồn về kho báu này cho biết đó là một loại vũ khí tối thượng có thể làm thay đổi cục diện chiến tranh tại Nhật. Sự kết hợp giữa kho báu đầy bí ẩn và thanh kiếm mà Kid đang săn lùng tạo nên một bức tranh phức tạp và nguy hiểm. Trong khi Kid tìm thanh kiếm, bóng đen bí ẩn của một "kiếm khách" cũng bắt đầu xuất hiện, hứa hẹn những sự kiện đầy kịch tính và đỉnh cao trí tuệ trong cuộc hành trình đầy nguy hiểm này.