Đây là phần tiếp theo SAINT SEIYA: THE HADES CHAPTER - SANCTUARY Sau một khoảng thời gian khá dài từ Chapter Santuary ( 12 - 2002 ) . Dự án Hades đã được Toei khởi động lại . Như đã biết từ phần Sanctuary , Saori Kido aka Athena đã tự nguyện xuống chốn tăm tối vĩnh cửu để đánh bại Minh Vương Hades . Linh hồn và thể xác của Xion đã hoàn toàn tan vào hư không . Dohko - Gold Saint Libra và Canon em trai của Gold Saint Gemini đã quyết định xuống Âm phủ để cứu Athena . Trong lúc đó linh hồn của 10 Gold Saint là Aioria , Aldebaran , Mur , Shaka , Milo , Death Mask , Shura , Camus , Aphrodite , Saga đang bị giam cầm ở tầng cuối cùng của địa ngục dưới tay chân của Hades . Seiya - Saint Pegasus đã quyết tâm xuống âm phủ để cứu người nữ thần - đồng thời là người yêu thương của anh.