Câu chuyện xảy ra trong tương lai xa. Đất đai bị hủy hoại, và nhân loại thành lập thành phố pháo đài di động tên Plantation. Các phi công sản xuất trong Plantation sống ở Mistilteinn, cũng được biết đến như "chimcage". Trẻ em sống ở đó không biết gì về thế giới bên ngoài và sự tự do của bầu trời. Cuộc sống của họ chỉ là chiến đấu để thực hiện nhiệm vụ. Kẻ thù của họ là những sinh vật khổng lồ bí ẩn có tên gọi là Kyōryū, và các con robot được gọi là Franxx để đối mặt với họ. Đối với trẻ em, cưỡi Franxx để chứng minh sự tồn tại của chúng. Một cậu bé tên là Hiro có Mã số: 016, và cậu đã từng được biết đến như một thần đồng. Tuy nhiên, cậu ta đã bị bỏ lại phía sau, và sự tồn tại của cậu ta dường như không cần thiết. Không lái thử một chiếc Franxx cũng giống như việc ngừng tồn tại. Một ngày kia, một cô gái bí ẩn được gọi là "Zero Two" xuất hiện trước mặt cậu ta. và cô gái mọc sừng bắt đầu câu chuyện mời bạn đón xem :D